История Fountaine Pajot началась на западе Франции в 70-х годах прошлого столетия. Именно тогда французский олимпионик, яхтсмен Жан-Франсуа Фонтен объединился со своими друзьями для выпуска швертботов олимпийского и международного класса.
Участники французской олимпийской сборной по яхтенному спорту оценили по достоинству усилия Фонтена и его друзей. И в 1978 году компаньоны уже нуждались в собственных производственных площадях для выполнения поступающих заказов. Такие нашлись поблизости от Ла-Рошели в Эгрефёй-д’Они. Рубеж 70-80-х годов прошлого столетия прошел для компании в активных поисках самой удачной технологии. Со временем она была найдена и применена для постройки многокорпусных судов, предназначенных для океанских круизов. По сути, Fountaine Pajot, применив инъекционную технологию производства корпуса лодки, сформировала рынок парусных и гибридных катамаранов, став пионером в этом сегменте.
Успеха работе верфи добавили престижные награды и призы гонок, в которых участвовали 18-метровый тримаран Royale и 21-метровый катамаран Charente Maritime.
В 1998 году верфь удивила яхтенный мир выпуском в серию катамаранов Maryland 37 и Greenland 34. С этого момента была взята высокая планка качества, не опускающаяся и по сей день. В нынешней линейке парусных катамаранов от этого производителя есть модели от 40 до 67 футов в классе «комфорт» и «элит». Круизные катамараны с моторами от этой верфи имеют длину корпусов от 30 до 40 футов.
Верфь Fountaine Pajot сменила несколько технологий производства и компоновки корпусов. Были значительно улучшены не только скоростные характеристики, но и уровень комфорта катамаранов. Значительные изменения претерпел и дизайн внутренних помещений под влиянием дизайнера Оливье Флаута, который существенно улучшил обитаемость катамаранов за счет увеличения объема корпуса и создания между ними комфортных жилых помещений.